35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6160 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  100 
 
 		 138 aa  273  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  67.16 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  56.83 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  54.01 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  43.85 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  38.06 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  38.73 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  39.42 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  39.57 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  41.84 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  37.4 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  34.53 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  34.29 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  33.11 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  31.01 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  32.32 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  27.07 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  30.37 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  36.28 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3424  PilT protein domain protein  30.87 
 
 		 155 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>