18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0411 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  72.34 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  45.6 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  35.83 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  31.71 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0412  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  28.47 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0900207  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  31.34 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  50 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  30.68 
 
 		 105 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0142  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  29.41 
 
 		 139 aa  40  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>