12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1544 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0195149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  40.85 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  34.59 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  29.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  26.81 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  28.12 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  29.77 
 
 		 139 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>