23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3783 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  265  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  45.04 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  47.33 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  41.79 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  43.28 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  42.96 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  37.59 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  35 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  34.4 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  37.4 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  36.97 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  34.56 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  34.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  35.11 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  36.05 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  27.42 
 
 		 136 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>