24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0480 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  277  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  43.48 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  42.96 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 176 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  49.54 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  38.03 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  37.78 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  43.88 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  39.84 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  37.04 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  37.68 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  31.15 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  32.87 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  30.91 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  30.5 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  28.97 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  27.01 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>