10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9186 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  100 
 
 		 146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9188  hypothetical protein  84.75 
 
 		 71 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  25.81 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  36.89 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  33.94 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  26.19 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  28.23 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  28.97 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>