17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3210 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  41.43 
 
 
141 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  38.93 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  42.74 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  41.94 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  44.72 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  31.78 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  32.82 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  30.6 
 
 
140 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  35.25 
 
 
139 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  34.59 
 
 
130 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  34.11 
 
 
141 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  37.38 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  28.47 
 
 
136 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2967  hypothetical protein  31.16 
 
 
133 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0071399  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  33.94 
 
 
146 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>