24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0407 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  52.24 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  39.67 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  34.53 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  33.94 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  26.9 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  34.06 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  28.95 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  26.62 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  29.73 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  28.23 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  29.58 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  28.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  30.99 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1444  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>