14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2889 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3272  hypothetical protein  32.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250729  normal  0.0598627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0381  hypothetical protein  30.53 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  25.81 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  29.6 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  28.23 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  26.26 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  31.11 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>