20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1316 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3887  PilT protein domain protein  35.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2984  PIN domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.212905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1705  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.138203 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4552  PilT protein-like  30.71 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2930  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1319  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112647  normal  0.582944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0381  hypothetical protein  32.79 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3051  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1776  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0693  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  31.48 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  27.74 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  25.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  32.74 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 147 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>