15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1783 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1705  PilT protein domain protein  31.21 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.138203 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4552  PilT protein-like  32.17 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1319  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112647  normal  0.582944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2930  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0693  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2597  hypothetical protein  29.77 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2984  PIN domain protein  29.77 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.212905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  31.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3051  PilT protein domain protein  34.35 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  29.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1776  PilT domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0797  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.424953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>