15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1319 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1319  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  279  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112647  normal  0.582944 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4552  PilT protein-like  78.26 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2930  PilT domain-containing protein  77.7 
 
 		 141 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3051  PilT protein domain protein  73.19 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1705  PilT protein domain protein  47.83 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.138203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1776  PilT domain-containing protein  39.44 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3887  PilT protein domain protein  36.07 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1699  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0322775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0693  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2597  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2984  PIN domain protein  29.32 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.212905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1967  PilT domain-containing protein  34.23 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>