18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0894 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1319  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112647  normal  0.582944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2930  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4552  PilT protein-like  34.31 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  29.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  29.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1783  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  27.21 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3051  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1705  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.138203 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0693  PilT domain-containing protein  29.03 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  37.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  30.82 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  29.58 
 
 		 136 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 134 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>