21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4992 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  32.89 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  31.29 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  31.29 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  35.09 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  26.28 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  29.14 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  28.1 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  27.21 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  30.41 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  34.01 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  35.9 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0381  hypothetical protein  32.11 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  27.33 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  30.17 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  32.26 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  24.49 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  25 
 
 
235 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  27.81 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>