15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3753 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  41.43 
 
 		 235 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  40.71 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  34.75 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  36.94 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  33.81 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  35.51 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  29.58 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  27.33 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  32.59 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>