15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3412 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  261  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  45.39 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  38.85 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  40.29 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  37.23 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 
235 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  35.97 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  28.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  33.1 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4432  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.352964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  30.36 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>