18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13202 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  95.83 
 
 
144 aa  263  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  46.81 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  40.29 
 
 
139 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  41.94 
 
 
235 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  37.14 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  41.59 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  37.86 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  35.56 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  35.56 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  30.41 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  27.21 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  30.95 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  34.07 
 
 
129 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>