28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0206 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  61.38 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  57.93 
 
 
147 aa  154  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  39.25 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  40.18 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  40.54 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  39.01 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  38.57 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  37.86 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  37.32 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  37.38 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  35.97 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  29.68 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0381  hypothetical protein  29.93 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3272  hypothetical protein  37.97 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250729  normal  0.0598627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  35.96 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  26.24 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  30.1 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  27.1 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  29.49 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  30.71 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0061  hypothetical protein  31.65 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  33.81 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  34.19 
 
 
143 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>