20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2877 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  100 
 
 		 129 aa  246  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0797  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.424953  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11990  hypothetical protein  43.94 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2967  hypothetical protein  45.8 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0071399  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  34.59 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  39.37 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  37.69 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4432  hypothetical protein  35.66 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.352964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1620  PilT protein domain protein  41.27 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26300  hypothetical protein  37.21 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.835764  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  32.09 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  31.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5933  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0433671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5531  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.37836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 235 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>