17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1620 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1620  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  253  7e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0797  PilT protein domain protein  50.39 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.424953  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  37.88 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  41.27 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2967  hypothetical protein  45.31 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0071399  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11990  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4432  hypothetical protein  36.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.352964 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5933  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0433671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5531  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.37836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  38.58 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26300  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.835764  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0256  hypothetical protein  35.48 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  35.97 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>