19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0230 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  287  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  45.07 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1290  hypothetical protein  67.9 
 
 
197 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.734735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1694  PilT domain-containing protein  40.85 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1187  PilT domain-containing protein  40.41 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  39.46 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  32.86 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2130  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.463542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  28.28 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  28.28 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  28.78 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  30.41 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  32.5 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  32.65 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0693  PilT domain-containing protein  30.67 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2930  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.156891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1316  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 
142 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>