17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3094 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  42.31 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  38.76 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  40.16 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  32.56 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  36.73 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  36.73 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  38.38 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  29.1 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  31.15 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>