23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10978 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  249  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  45.74 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  41.27 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  46.21 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  38.32 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  37.1 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  43.56 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  39.53 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  39.82 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  36.21 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  32.59 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 128 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  25.66 
 
 		 132 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  37.07 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  33.88 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  24.17 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  24.79 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0184  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>