20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3666 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3666  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  256  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  44 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2113  PilT protein-like  52.69 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  42.98 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  48.78 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  39.84 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  34.17 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  39.2 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  38.21 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  34.92 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  41.32 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 		 132 aa  43.9  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  33.33 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  31.2 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>