209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0337 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  98.9 
 
 
273 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  88.43 
 
 
270 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  40.46 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  43.72 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  41.99 
 
 
266 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  40.87 
 
 
291 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  40.3 
 
 
265 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  37.06 
 
 
289 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  41.27 
 
 
277 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  30.9 
 
 
269 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  30.9 
 
 
270 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
273 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
294 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
292 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
294 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  39.58 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  35.5 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  40 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  39.91 
 
 
274 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  38.79 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  34.06 
 
 
288 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  35.97 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
286 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  35.62 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  38.3 
 
 
256 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  38.82 
 
 
272 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.88 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  33.85 
 
 
276 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
311 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  35.44 
 
 
271 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  30.45 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  25.97 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.62 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  23.65 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  28.02 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  25.55 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  27.04 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
363 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  33.14 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  33.14 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2586  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.309935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  27.44 
 
 
706 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  30.22 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  27.23 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
326 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  30.7 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0339  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
303 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0118418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  22.82 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.78 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
364 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  29.12 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0572  metallophosphoesterase  25.39 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  31.64 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  23.14 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
366 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  25.72 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
366 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
332 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  24.11 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  34.34 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
331 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
307 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3181  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
314 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1644  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  37.65 
 
 
1183 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  34.12 
 
 
775 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  23.9 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  24.73 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4868  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
425 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225896  normal  0.165863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36260  predicted phosphohydrolase  27.8 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.856531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2349  metallophosphoesterase  22.73 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  26.71 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
611 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  35.9 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  27.56 
 
 
726 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  28.91 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>