96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4196 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  88.7 
 
 		 292 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  78.28 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  70.55 
 
 		 298 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  62.46 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  59.53 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  57.19 
 
 		 301 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  47.28 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  46.46 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  47.97 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  44.74 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  45.79 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  45.76 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  44.67 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  44.33 
 
 		 331 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  44.33 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  44.48 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  42.14 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  43.06 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.44 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  42.39 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  46.21 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  44.76 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  42.11 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  46.64 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  41.73 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  41.37 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  40.73 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  36.4 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  34.88 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  38.04 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  38.04 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.09 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.46 
 
 		 222 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  30.7 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  25.27 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28.23 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  32.42 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  31.05 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  23.97 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  31.05 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  29.57 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  23.02 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  28.78 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  24.73 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  32.02 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  23.94 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  27.33 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  21.72 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  21.69 
 
 		 606 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  32.42 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  29.61 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  30.59 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  27.62 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  28.9 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  31.35 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  31.56 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  25.39 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  23.28 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  26.52 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  30.59 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  34.2 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  27.33 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  24.88 
 
 		 726 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1581 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  25.44 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  24.32 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  29.05 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  29.59 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  33.94 
 
 		 422 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  29.09 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 440 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  27.84 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  28.96 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01365  hypothetical protein  26.79 
 
 		 406 aa  42.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>