86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3826 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  100 
 
 
271 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  64.2 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  43.37 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
271 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  42.65 
 
 
274 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  42.16 
 
 
277 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  40 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  40.16 
 
 
266 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  42.52 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  37.31 
 
 
291 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  40.66 
 
 
272 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  31.39 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  40.32 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  40.26 
 
 
267 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  34.25 
 
 
278 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
288 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  35.39 
 
 
273 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  29.93 
 
 
274 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  36.07 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
311 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  36.13 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  35.44 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  33.75 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  27.51 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  38.86 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  32.94 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
363 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  28.18 
 
 
366 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  27.62 
 
 
369 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  28.83 
 
 
706 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.41 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.79 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  25.37 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  29.82 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
357 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  26.73 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  28.66 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  31.98 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  27.7 
 
 
290 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  46.05 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  27.22 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  30.33 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
466 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.05 
 
 
1183 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
331 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.74 
 
 
1901 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.96 
 
 
1330 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  29.7 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  24.85 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1394  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
369 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  51.79 
 
 
1766 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  29.59 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.8 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>