121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3261 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  100 
 
 		 318 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  78.41 
 
 		 301 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  60.93 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  61.46 
 
 		 298 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  59.53 
 
 		 292 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  59.53 
 
 		 292 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  60.63 
 
 		 293 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  48.43 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  46.83 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  45.49 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  44.11 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  44.34 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  45.33 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  44.01 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  46.64 
 
 		 316 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  45.14 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  49.11 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  44.1 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  46.48 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  43.46 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  40.92 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.38 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  42.46 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  40.58 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  44.66 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  40.65 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  38.59 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  39.02 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  37.54 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  36.64 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  35.53 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  37.15 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  35.74 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  32.05 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.8 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  28.79 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  29.73 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  30.26 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  31.6 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.33 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  29.9 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  29.58 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  30.81 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  25.54 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  27.23 
 
 		 265 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  25.41 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  22.37 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  26.27 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  25 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  27.56 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  28.57 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  30.41 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  30.41 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.58 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  32.65 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  29.47 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  24.06 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  24.71 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.69 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  26.88 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  25.99 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  28.5 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  40.74 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  20.9 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  28.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  24.28 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  31.25 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  25.85 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  23.5 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  20.22 
 
 		 606 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  25.54 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.19 
 
 		 1183 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  30.57 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  27.96 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  24.09 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  33.94 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  25.38 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  25.86 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  28.23 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.74 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  27.19 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  27.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  29.53 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.67 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  30.61 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1581 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  40.79 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>