157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1721 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  65.94 
 
 
277 aa  348  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  70.08 
 
 
272 aa  317  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  63.02 
 
 
274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  61.63 
 
 
274 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  57.36 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  57.83 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  55.82 
 
 
266 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  52.17 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  41.73 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  42.52 
 
 
271 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  42.31 
 
 
270 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  40.3 
 
 
273 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  39.06 
 
 
273 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  38.43 
 
 
292 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  38.43 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  35.82 
 
 
289 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  36.86 
 
 
294 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  40.48 
 
 
267 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
286 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
296 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
262 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
274 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  29.41 
 
 
270 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  34.9 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  28.15 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  34.7 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  34.24 
 
 
278 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  33.63 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  31.8 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  30 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.24 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
326 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.63 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  28.43 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.92 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  27.5 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  35.8 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  24.85 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  24.52 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  28.73 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0763  phosphohydrolases  27.32 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
270 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  28.99 
 
 
318 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  27.14 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  29.26 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
616 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  25.58 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
1818 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1476  phosphoesterase  25.58 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195821  hitchhiker  0.0000667392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  25.63 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3572  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.81 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000400387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3471  Ser/thr protein phosphatase family protein  25.81 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000520095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3856  Ser/thr protein phosphatase family protein  25.81 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000402293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.81 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18661e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.53 
 
 
611 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.96 
 
 
1330 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3484  Ser/thr protein phosphatase family protein  25.35 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0169244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  20.1 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  30.32 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.95 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  35.37 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  22.32 
 
 
410 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  30.39 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  30.39 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  30.32 
 
 
300 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  29.83 
 
 
316 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
266 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>