96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4875 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  100 
 
 
293 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  77.59 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  78.28 
 
 
292 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  67.69 
 
 
298 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  59.12 
 
 
297 aa  341  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  60.63 
 
 
318 aa  338  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  57.58 
 
 
301 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  48.64 
 
 
307 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  46.29 
 
 
301 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  45.52 
 
 
315 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
331 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  44.83 
 
 
316 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  44.41 
 
 
303 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  45.36 
 
 
298 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  42.71 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  43.39 
 
 
303 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  43.21 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  43.05 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  45.52 
 
 
298 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.34 
 
 
294 aa  202  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  39.57 
 
 
300 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  40.36 
 
 
302 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  41.75 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  46.1 
 
 
307 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  41.49 
 
 
307 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  39.64 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  38.95 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  38.91 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  34.86 
 
 
307 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  37.28 
 
 
307 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  38.32 
 
 
307 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
326 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  36.56 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.82 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.24 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  30.04 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25.99 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  26.24 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  24.92 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  32.68 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  26.34 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  26.78 
 
 
269 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  25.91 
 
 
311 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.17 
 
 
1581 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  26.84 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  31.67 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
440 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
422 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
357 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  24.34 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  22.71 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.28 
 
 
1186 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  23.17 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  24.4 
 
 
1200 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  26.87 
 
 
273 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.28 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  22.31 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  28.16 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  26.23 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  27.51 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.47 
 
 
1831 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  25.14 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5406  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
615 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  34.11 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  25.45 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  21.52 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  28.41 
 
 
730 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>