41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1861 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  100 
 
 
288 aa  599  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  54.51 
 
 
288 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  54.01 
 
 
291 aa  355  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  56.89 
 
 
287 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  52.65 
 
 
286 aa  333  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  55.9 
 
 
290 aa  334  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  49.48 
 
 
286 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  23.97 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  24.82 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  25.34 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  26.77 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  24.72 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  23.36 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  24.18 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  24.35 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  24.35 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
268 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
268 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  22.88 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  35.87 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  23 
 
 
302 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  35.37 
 
 
245 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  23.57 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  22.87 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  22.63 
 
 
364 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>