116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2266 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  100 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  60.4 
 
 
306 aa  347  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  56.76 
 
 
298 aa  319  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  55.41 
 
 
298 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  52.01 
 
 
316 aa  291  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  51.34 
 
 
331 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  51.97 
 
 
307 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  51.34 
 
 
315 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  47.74 
 
 
297 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  44.98 
 
 
303 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
292 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.25 
 
 
294 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  43.4 
 
 
301 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
307 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  45.72 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  45.39 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  43.46 
 
 
318 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  40.07 
 
 
298 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  42.72 
 
 
307 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  39.86 
 
 
300 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  42.71 
 
 
293 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  40.36 
 
 
302 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  40.88 
 
 
302 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  40.71 
 
 
302 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  44.63 
 
 
332 aa  188  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  40.31 
 
 
326 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  40.61 
 
 
307 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
307 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  38.33 
 
 
307 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  37.54 
 
 
307 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  36.49 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
252 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.13 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  24.27 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  32.02 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  24.32 
 
 
606 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  32.37 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  24.43 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  21.68 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  28.43 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  27.55 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  27.55 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  33.77 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  32.71 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.72 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  26.86 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.89 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
275 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  32.19 
 
 
282 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  28.63 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
284 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
1831 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  29.44 
 
 
265 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  28.95 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.87 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.21 
 
 
274 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
266 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.96 
 
 
275 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
274 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
275 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  22.01 
 
 
286 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  27.34 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  30.81 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.66 
 
 
354 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2057  metallophosphoesterase  28.31 
 
 
313 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  23.57 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.42 
 
 
325 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  22.27 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  31.61 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  31.74 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>