86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2972 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  100 
 
 
331 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  99.68 
 
 
315 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  91.05 
 
 
316 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  69.54 
 
 
307 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  67.34 
 
 
298 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  67.91 
 
 
298 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  51.34 
 
 
300 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  52.9 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  46.05 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  44.01 
 
 
318 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  43.54 
 
 
297 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  44.33 
 
 
292 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  44.22 
 
 
298 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  43.1 
 
 
293 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  41.78 
 
 
307 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  41.81 
 
 
301 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  43.3 
 
 
300 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  43 
 
 
303 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  42.62 
 
 
307 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  40.56 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  42.28 
 
 
300 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
302 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  43.33 
 
 
332 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.22 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  39.32 
 
 
302 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  39.43 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  38.49 
 
 
326 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  37.7 
 
 
307 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  39.46 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  38.49 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
309 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  33.92 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  27.9 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  31.12 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  25.64 
 
 
290 aa  60.1  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
273 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  32.27 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.42 
 
 
230 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
223 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  24.35 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  24.78 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.46 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  23.48 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  32.04 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  31.13 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  30.39 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.03 
 
 
1831 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
275 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  23.91 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  28.15 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.4 
 
 
1330 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  29.83 
 
 
284 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  26.78 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
252 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  31.43 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
245 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
278 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>