177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1233 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  100 
 
 
230 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  64.57 
 
 
222 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  43.23 
 
 
274 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  42.93 
 
 
271 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  37.81 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
296 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  25.91 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
332 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  23.51 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  21.82 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  25.56 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  26.24 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  25.56 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  24.09 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  25.24 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
298 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  26.63 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  25 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  24.26 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
277 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  27.54 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  25 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
274 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  26.14 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  32.1 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
311 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  22.69 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0504  metallophosphoesterase  24.31 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0551337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  25.23 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  23.56 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  25.74 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  24.59 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.42 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  23.26 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
278 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  20.83 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  25.37 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  22.07 
 
 
277 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
315 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  26.73 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
331 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  25 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
316 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
307 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  24.04 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
307 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
301 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
354 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  23.95 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.91 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  25 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  20.18 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.57 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.66 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3471  Ser/thr protein phosphatase family protein  24.78 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000520095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  22.33 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.78 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18661e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8262  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  26.52 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  27.43 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  26.04 
 
 
284 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
364 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3776  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.32 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000444173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
606 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>