150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3290 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  42.8 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  42.8 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  42.09 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  38.93 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  40.93 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  36.71 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  36.71 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  37.72 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  39.75 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  36.94 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  38.37 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  36.86 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  37.4 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  35.47 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  37.35 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  36.73 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  35.94 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  34.18 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  26.06 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  32.03 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  38.49 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  30.29 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  30.59 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  30.54 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  34.72 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  36.25 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  32.86 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  30.12 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  30.04 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.95 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  30.42 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  32.27 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  32.27 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  27.72 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  31.98 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  31.31 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  32.13 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  32.62 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  27.46 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  27.2 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  29.75 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  30.48 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.92 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  44.16 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.07 
 
 		 1183 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.35 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  29.93 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  29.63 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 369 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  44.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2104  metallophosphoesterase  38.55 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  44.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  32.99 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  32.03 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0339  metallophosphoesterase  32.84 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0118418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0256  metallophosphoesterase  36.59 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 872 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.286958  normal  0.282357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  38.75 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_002620  TC0746  hypothetical protein  35.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.522504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2087  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  28.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  27.34 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  38.75 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  28.18 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  27.63 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  23.81 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  32.56 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  23.11 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  41.56 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.79 
 
 		 1330 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  36.71 
 
 		 1138 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  27.22 
 
 		 606 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  34.94 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  38.1 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  29.61 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  31.03 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  38.75 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  32 
 
 		 611 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>