101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4050 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  88.7 
 
 
292 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  77.59 
 
 
293 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  68.84 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  62.12 
 
 
297 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  59.53 
 
 
318 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  58.95 
 
 
301 aa  332  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  48.65 
 
 
307 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  46.51 
 
 
303 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  45.97 
 
 
301 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  46.51 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  46.49 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  45.52 
 
 
315 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  44.64 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  45.17 
 
 
298 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
300 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.71 
 
 
294 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  46.55 
 
 
298 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  44.76 
 
 
332 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  41.82 
 
 
302 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  40.22 
 
 
300 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  41.84 
 
 
307 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  41.73 
 
 
302 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  41.37 
 
 
302 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  46.29 
 
 
307 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  41.82 
 
 
307 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  36.43 
 
 
326 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  36.75 
 
 
307 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1046  metallophosphoesterase  38.57 
 
 
307 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.541115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0989  metallophosphoesterase  39.49 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1050  metallophosphoesterase  39.13 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  32.3 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.36 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.69 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  25.43 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  24.49 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  30.27 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  25.24 
 
 
269 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  30.64 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  23.44 
 
 
410 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  27.07 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  24.72 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  29.61 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  23.9 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  29.63 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  28.15 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  23.96 
 
 
252 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  20.11 
 
 
606 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  30.05 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  23.2 
 
 
252 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  30.59 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  29.77 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  27.49 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
357 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  24.42 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  34.2 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  25 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  26.96 
 
 
440 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  27.33 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  22.46 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
422 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  21.66 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.26 
 
 
354 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.26 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.52 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  25.41 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  30.52 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.52 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.52 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.52 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  25.39 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>