104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0680 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  100 
 
 
274 aa  563  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  79.09 
 
 
278 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  43.07 
 
 
288 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  44.19 
 
 
276 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  37.93 
 
 
273 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
296 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
292 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
294 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  36.99 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  36.89 
 
 
267 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
273 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  34 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  34.8 
 
 
265 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  32.96 
 
 
291 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  32.28 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  32.44 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  34.05 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  27.39 
 
 
270 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  26.67 
 
 
269 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28.01 
 
 
311 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
272 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  27.07 
 
 
274 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  29.93 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
278 aa  89  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  27.42 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.11 
 
 
222 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.39 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
357 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3154  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  27.9 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
364 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
298 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  27.36 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  26.58 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  26.96 
 
 
366 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  28.89 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1166  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
641 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0143203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7562  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.790874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.75 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  34.34 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.32 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.32 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  25.43 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0073  metallophosphoesterase  29.68 
 
 
619 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1005  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
631 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000460676  hitchhiker  0.000515762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  36.56 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
307 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.27 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
466 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0250  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
630 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.663212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
332 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0359  hypothetical protein  28.12 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460569  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1132  cytoplasmic membrane protein  22.45 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00503148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3492  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00129162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1476  phosphoesterase  30.14 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195821  hitchhiker  0.0000667392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
1818 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  22.51 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3572  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.51 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000400387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3471  Ser/thr protein phosphatase family protein  31.51 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000520095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3484  Ser/thr protein phosphatase family protein  31.51 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0169244  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3856  Ser/thr protein phosphatase family protein  31.51 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000402293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  30.14 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.51 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18661e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
632 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  35.29 
 
 
383 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  35.37 
 
 
366 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  24.47 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
473 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  25.99 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  28.74 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3754  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.14 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  31.86 
 
 
382 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.88 
 
 
1831 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  22.99 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>