135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4425 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  99.32 
 
 
294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  90.14 
 
 
294 aa  534  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  44.53 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  41.58 
 
 
289 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  37.92 
 
 
291 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  39.52 
 
 
277 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  36 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  38.35 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
273 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  38.43 
 
 
265 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
274 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  37.31 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  37.31 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  36.03 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  34.92 
 
 
274 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  35.16 
 
 
288 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  29 
 
 
270 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  29.59 
 
 
269 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
271 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  34.33 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  35.11 
 
 
276 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  32.33 
 
 
278 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  40.41 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  32.44 
 
 
282 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  34.02 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  35.77 
 
 
272 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
256 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
252 aa  89.7  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.2 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  26.79 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  52.78 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  48.61 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  48.61 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  23.96 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.73 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  48.61 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  31.05 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  27.4 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  27.4 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.99 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  29.66 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  24.38 
 
 
369 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
594 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  25 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
706 aa  52.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  29.06 
 
 
265 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4875  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  25.61 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_002620  TC0746  hypothetical protein  35.06 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.522504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  21.4 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
616 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  31.8 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
1818 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  30.53 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  26.19 
 
 
1186 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.8 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  38.75 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  22.55 
 
 
611 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  41.25 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2087  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  38.75 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.48 
 
 
1183 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  23.87 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  28.7 
 
 
307 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
239 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
239 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>