89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2182 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  61.63 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  57.47 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  60.62 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  57.31 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  57.78 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  55.34 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  52.47 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  62.02 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  42.65 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  40.38 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  41.71 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  40.34 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  39.06 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  34.92 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  34.92 
 
 		 294 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  37.35 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  39.91 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  39.91 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  34.01 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  32.35 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  38.91 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  36.63 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  36.32 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  33.05 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  30.45 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  29.02 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  31.67 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  36.68 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  27.07 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  27 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  25.75 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  21.82 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  30.89 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  31.98 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  29.73 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0135  icc-related protein  31.79 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.280285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  30.81 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  20.38 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  29.61 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  27.03 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  26.88 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  26.88 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  32.42 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  26.5 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0892  metallophosphoesterase  27.32 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  28.11 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  26.61 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  25.85 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.18 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  23.4 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3442  metallophosphoesterase  28 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  0.817537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  30.96 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  28.65 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  33.08 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  28.88 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  23 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  24.12 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.45 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  26.24 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  30.72 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  27.17 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1064  metallophosphoesterase  33.72 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000589961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  24.77 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  25.74 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  24.18 
 
 		 1186 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.18 
 
 		 2852 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  25.51 
 
 		 2701 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  34.88 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3064  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283144  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.25 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  37.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  37.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  22.38 
 
 		 297 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>