67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3489 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  100 
 
 
256 aa  506  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  64.2 
 
 
271 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  45.56 
 
 
274 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  41.02 
 
 
266 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  39.84 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  40.38 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  41.73 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  42.16 
 
 
277 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  38.13 
 
 
271 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  38.17 
 
 
291 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
272 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
296 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
292 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
294 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
270 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  34.27 
 
 
294 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  38.3 
 
 
273 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  38.3 
 
 
273 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  27.31 
 
 
270 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  26.94 
 
 
269 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  36.25 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.66 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  31.73 
 
 
286 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  35.77 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  37.73 
 
 
262 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  34.25 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  37.93 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  37.82 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  28.83 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  33.76 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  36.95 
 
 
282 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  36.93 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.48 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  24.46 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.41 
 
 
222 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
301 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  32.02 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  22.55 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  25 
 
 
369 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
307 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  24.21 
 
 
357 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6039  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  34.04 
 
 
1330 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
326 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  31.63 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
286 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  22.39 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  22.39 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.66 
 
 
611 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  23.15 
 
 
314 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
312 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
318 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  26.27 
 
 
239 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  26.27 
 
 
239 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  22.66 
 
 
314 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>