103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2358 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2358  metallophosphoesterase  100 
 
 
272 aa  553  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  70.08 
 
 
265 aa  363  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2868  metallophosphoesterase  61.23 
 
 
277 aa  321  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.236712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  61.51 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2543  metallophosphoesterase  60.92 
 
 
271 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.496359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2182  putative DNA repair exonuclease  62.02 
 
 
274 aa  294  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  56.18 
 
 
266 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2851  metallophosphoesterase  54.98 
 
 
266 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0131922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  50.96 
 
 
291 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3826  metallophosphoesterase  40.66 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703659  normal  0.184738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3489  metallophosphoesterase  40.3 
 
 
256 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841286  normal  0.462378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
294 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
294 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  40.08 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1395  metallophosphoesterase  35.88 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.540293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1981  metallophosphoesterase  39.83 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0337  phospodiesterase  40.51 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.669687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3290  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
289 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0083  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2380  metallophosphoesterase  40.18 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0169412  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3901  metallophosphoesterase  42.74 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1260  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
296 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0680  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534787  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0221  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.510985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2949  metallophosphoesterase  34.7 
 
 
276 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158602  hitchhiker  0.00186022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1186  metallophosphoesterase  31.77 
 
 
288 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00040715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2336  metallophosphoesterase  35.43 
 
 
278 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  27.27 
 
 
270 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  26.82 
 
 
269 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2244  metallophosphoesterase  30.21 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0134  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3321  metallophosphoesterase  29.92 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0980  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1378  metallophosphoesterase  25.99 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.831102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1658  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3174  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25 
 
 
222 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0822292  hitchhiker  0.000980029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5676  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1233  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  22.07 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.77 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.81 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3418  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.28 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  24.5 
 
 
363 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
366 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
366 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  30.3 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1810  metallophosphoesterase  24 
 
 
706 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1601  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1512  hypothetical protein  28.34 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0641  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2266  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3261  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  40.58 
 
 
282 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  40.58 
 
 
282 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1564  hypothetical protein  24.32 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  36.14 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  25.12 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  39.13 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  40.58 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2257  putative metallo-phosphoesterase  25.85 
 
 
297 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118894  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2634  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0763  phosphohydrolases  24.74 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  27.78 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  27.55 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.97 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1367  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6827  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  23.66 
 
 
369 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3243  hypothetical protein  28.12 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  30.86 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  39.44 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  39.44 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  36.47 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  21.57 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1476  phosphoesterase  24.64 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195821  hitchhiker  0.0000667392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.95 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2187  metallophosphoesterase  25.97 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2104  metallophosphoesterase  40.54 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  23.59 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  22.41 
 
 
402 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.56 
 
 
616 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
1818 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.95 
 
 
386 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.43 
 
 
3977 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>