185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0534 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  100 
 
 
279 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  32.24 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.89 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.33 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
279 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30.49 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.67 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.67 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.79 
 
 
279 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.27 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.07 
 
 
279 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.17 
 
 
279 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  30.27 
 
 
279 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  28.57 
 
 
278 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  32.81 
 
 
269 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.19 
 
 
271 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  30.34 
 
 
237 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  35.21 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.8 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  31.53 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  26.02 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.26 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.11 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  28.23 
 
 
266 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  29.12 
 
 
280 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  30 
 
 
272 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
271 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.48 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.6 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.57 
 
 
274 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.92 
 
 
266 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.49 
 
 
275 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.91 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  29.51 
 
 
256 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  27.52 
 
 
266 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  27.84 
 
 
271 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  31.43 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  26.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.89 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.89 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.67 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.89 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.89 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.2 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.42 
 
 
268 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  25.58 
 
 
272 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.64 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.45 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.32 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.91 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  26.91 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.31 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  30 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.67 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  24.52 
 
 
263 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.51 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.51 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.51 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.51 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.51 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  25.91 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.8 
 
 
275 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  28.31 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.23 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.1 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  29.17 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  27.24 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  28.26 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  26.79 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  27.49 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  25.26 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  28.73 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  26.5 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  23.55 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>