96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1206 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1206  type III secretion protein HrcT  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1393  type III secretion protein HrcT  83.71 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0048  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  72.35 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1883  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.64 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2214  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.24 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01724  Type III secretory pathway, component EscT  33.2 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0848  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.96 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.669729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3016  type III secretion apparatus protein EpaR  29.96 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000240675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3182  type III secretion apparatus protein EpaR  29.96 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0047  type III secretion apparatus protein YscT  31.36 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000121402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003360  type III secretion protein SpaR  31.02 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42640  translocation protein in type III secretion  32.93 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2413  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.61 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3749  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.18 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.514144  normal  0.0208478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4742  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.49 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4220  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.49 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0190073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5439  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.38 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507551  normal  0.0986241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3521  Type III secretion protein SpaR/YscT  28.38 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137102  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4845  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.38 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000112612  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  34.76 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0455  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.65 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170011  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  34.15 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1753  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1517  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0297433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1922  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1531  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1554  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2290  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.85 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2208  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.85 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1944  putative type III secretion inner membrane protein SctT  26.85 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0624  putative type III secretion inner membrane protein SctT  26.85 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1639  putative type III secretion inner membrane protein SctT  26.85 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.895594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0688  SctT  26.85 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5632  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.57 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.030124 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5849  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.57 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.77 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0189  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  25.45 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.77 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.77 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0872  Hrp conserved HRCT transmembrane protein  27.36 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224699  hitchhiker  0.00958817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0742  type III secretion inner membrane protein SctT, putative  24.71 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.588994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1988  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.91 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1895  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.91 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0420  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.91 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3010  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.3 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  23.59 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3198  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3093  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3078  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3010  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3041  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0112  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  25.21 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0838  type III secretion system protein BsaY  26.32 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03394  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  25.35 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1534  type III secretion system protein BsaY  26.9 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0660694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0750  type III secretion system protein BsaY  26.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0575  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.9 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2077  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2165  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2070  type III secretion system protein BsaY  26.9 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3121  putative type III secretion system innermembrane protein, HcrT/YscT-like  32.03 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000139463  hitchhiker  0.00260943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  26.19 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  24.2 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  23.58 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  23.64 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.3 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  28.5 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.9 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  22.36 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  21.24 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  24.55 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.11 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  25.54 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.98 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  24.66 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5941  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  22.32 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420279  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  26.46 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.64 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0853  type III secretion inner membrane protein SctT  24.77 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.761324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  23.08 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.65 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5210  type III secretion system inner membrane R protein  25 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  24.57 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  23.27 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  23.89 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  24.88 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1408  type III secretion system inner membrane R protein  28.12 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0961  type III secretion system inner membrane R protein  23.95 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 		 256 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 		 256 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>