276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1408 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1408  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 
258 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.3 
 
 
259 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  33.91 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  28.25 
 
 
264 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.84 
 
 
264 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 
265 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.34 
 
 
255 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  28.29 
 
 
265 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  30.58 
 
 
260 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.5 
 
 
261 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  28.97 
 
 
253 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  29.38 
 
 
253 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.78 
 
 
261 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  27.23 
 
 
260 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  29.96 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  30.92 
 
 
257 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.79 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.78 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.67 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.28 
 
 
260 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  26.64 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.18 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.77 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  27.54 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  26.48 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  26.94 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  24.34 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 
253 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  32.11 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  26.11 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  26.89 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  28.92 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  25.35 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  25.24 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  27.14 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  24.18 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.1 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  30.52 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  25.65 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1591  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1555  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.751445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  27.11 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1714  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1591  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.311192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.96 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3610  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.400398  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1734  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1765  flagellar biosynthesis protein FliR  25.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  28.18 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  30.25 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  26.95 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  24.88 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  25.88 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  26.82 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  28.18 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1788  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1544  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.903592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  29.52 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1843  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0356733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.51 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  28.51 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.77 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  31.45 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  27.44 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  27.18 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  31.48 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  30.14 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  26.02 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  24.64 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  22.82 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  29.86 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  25.82 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  24.48 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  27.59 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  22.41 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  25.4 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0171793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  27.6 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>