216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0624 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0624  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
364 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1639  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
334 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.895594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1944  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
328 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2290  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  99.63 
 
 
322 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0688  SctT  99.63 
 
 
531 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2208  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  99.63 
 
 
322 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0742  type III secretion inner membrane protein SctT, putative  89.96 
 
 
330 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.588994  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5632  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  52.9 
 
 
268 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.030124 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5849  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  52.9 
 
 
268 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0420  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1988  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1895  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5941  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.06 
 
 
269 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420279  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0872  Hrp conserved HRCT transmembrane protein  39.42 
 
 
282 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224699  hitchhiker  0.00958817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0455  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  38.49 
 
 
284 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170011  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03394  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  40.59 
 
 
276 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4742  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.19 
 
 
269 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4220  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.19 
 
 
269 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0190073  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5439  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.63 
 
 
269 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507551  normal  0.0986241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3749  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.88 
 
 
270 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.514144  normal  0.0208478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3521  Type III secretion protein SpaR/YscT  31.63 
 
 
269 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137102  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4845  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.63 
 
 
269 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000112612  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01724  Type III secretory pathway, component EscT  31.33 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003360  type III secretion protein SpaR  29.49 
 
 
241 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  34.67 
 
 
266 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  35.33 
 
 
266 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1753  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1517  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0297433  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0047  type III secretion apparatus protein YscT  29.63 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000121402  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1531  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1554  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1922  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42640  translocation protein in type III secretion  32.52 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837601  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0848  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.14 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.669729  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3016  type III secretion apparatus protein EpaR  31.14 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000240675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2413  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.53 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  43.53 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  37.11 
 
 
1408 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3182  type III secretion apparatus protein EpaR  29.94 
 
 
255 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  39.74 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  44.78 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  31.02 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  37.78 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.22 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3010  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.52 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  38.68 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 
265 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  44.74 
 
 
474 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  35.06 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  42.39 
 
 
813 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  26.22 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  40 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  39.47 
 
 
274 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  43.16 
 
 
585 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  43.01 
 
 
643 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0189  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.12 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  42.11 
 
 
712 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  38.53 
 
 
606 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3121  putative type III secretion system innermembrane protein, HcrT/YscT-like  26.8 
 
 
265 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000139463  hitchhiker  0.00260943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  41.67 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  41.67 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1206  type III secretion protein HrcT  26.85 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  44.74 
 
 
639 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  41.46 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  38.82 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 
259 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
256 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  38.61 
 
 
512 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  29.57 
 
 
261 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  36.84 
 
 
252 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0838  type III secretion system protein BsaY  29.35 
 
 
251 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  39.74 
 
 
445 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 
263 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  39.53 
 
 
481 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  39.53 
 
 
478 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  35.34 
 
 
582 aa  59.7  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1883  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.22 
 
 
267 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  34.38 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  35.34 
 
 
587 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.08 
 
 
523 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  34.69 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0048  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  24.42 
 
 
266 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  41.33 
 
 
842 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  28.12 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  41.11 
 
 
1147 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1393  type III secretion protein HrcT  26.88 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1534  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0660694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  33.56 
 
 
706 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  33 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  28.48 
 
 
253 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2070  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2165  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.59 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2077  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.59 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0750  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>