135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1944 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1944  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
328 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1639  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
334 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.895594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2290  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  95.73 
 
 
322 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2208  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  96.34 
 
 
322 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0624  putative type III secretion inner membrane protein SctT  100 
 
 
364 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0688  SctT  95.77 
 
 
531 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0742  type III secretion inner membrane protein SctT, putative  89.96 
 
 
330 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.588994  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5849  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  52.26 
 
 
268 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5632  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  52.26 
 
 
268 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.030124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0420  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1988  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1895  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.26 
 
 
272 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5941  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  48.06 
 
 
269 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420279  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0872  Hrp conserved HRCT transmembrane protein  39.42 
 
 
282 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224699  hitchhiker  0.00958817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0455  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  38.49 
 
 
284 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170011  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03394  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  40.59 
 
 
276 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4220  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.34 
 
 
269 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0190073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4742  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.34 
 
 
269 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3749  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.88 
 
 
270 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.514144  normal  0.0208478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5439  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.78 
 
 
269 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507551  normal  0.0986241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3521  Type III secretion protein SpaR/YscT  31.78 
 
 
269 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137102  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4845  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.78 
 
 
269 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000112612  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01724  Type III secretory pathway, component EscT  31.33 
 
 
260 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003360  type III secretion protein SpaR  29.61 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  35.33 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  34.67 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0047  type III secretion apparatus protein YscT  29.63 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000121402  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1753  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1517  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0297433  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1922  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42640  translocation protein in type III secretion  32.52 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837601  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1531  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1554  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.48 
 
 
259 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3016  type III secretion apparatus protein EpaR  31.14 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000240675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0848  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.14 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.669729  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2413  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.53 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  32.65 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3182  type III secretion apparatus protein EpaR  29.94 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  31.02 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  28.88 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3010  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  30.52 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  35.06 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  26.22 
 
 
258 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0189  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.12 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1206  type III secretion protein HrcT  26.85 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3121  putative type III secretion system innermembrane protein, HcrT/YscT-like  26.8 
 
 
265 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000139463  hitchhiker  0.00260943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
256 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
247 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  29.57 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1883  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  28.22 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0838  type III secretion system protein BsaY  29.35 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  28.12 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1534  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0660694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0575  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.59 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2070  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2165  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.59 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2077  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.59 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0750  type III secretion system protein BsaY  29.59 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0048  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  24.42 
 
 
266 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 
264 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  28.48 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  25.54 
 
 
263 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1393  type III secretion protein HrcT  26.88 
 
 
264 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.74 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  27.88 
 
 
253 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0853  type III secretion inner membrane protein SctT  23.17 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.761324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  29.87 
 
 
240 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  27.56 
 
 
253 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  24.08 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.35 
 
 
247 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  25.48 
 
 
252 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  29.01 
 
 
256 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  23.53 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  23.81 
 
 
259 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5210  type III secretion system inner membrane R protein  26.57 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420892  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.52 
 
 
265 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.3 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  26.17 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2214  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  26.43 
 
 
266 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  25.44 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  24 
 
 
266 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  30.77 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  26.55 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  28.43 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  26.52 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  27.27 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  29.67 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.92 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.33 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.58 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>