120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1632 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1632  co-chaperone Hsc20  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0172697  hitchhiker  0.0000179444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1480  co-chaperone Hsc20 heat shock proteins related  53.8 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0198146 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1659  co-chaperone Hsc20  50 
 
 
193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.643241  hitchhiker  0.00055225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  36.97 
 
 
174 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  36.97 
 
 
174 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  36.97 
 
 
174 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  33.94 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  34.57 
 
 
173 aa  95.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  33.12 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  36.54 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  34.12 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  32.69 
 
 
172 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  34.12 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  33.94 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  36.69 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  33.53 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  35.5 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  36.94 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  35.5 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  36.31 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1247  co-chaperone HscB  33.74 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.706414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  31.36 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  34.73 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  32.74 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  31.76 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  33.13 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  34.38 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3508  co-chaperone HscB  37.93 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.935785  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  31.55 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  33.33 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  34.91 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  36.88 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  36.84 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  32.94 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  36.8 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  31.18 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  33.52 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  33.33 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  32.53 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  40.37 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  32.54 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  33.14 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  35.2 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  31.03 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  39.81 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  39.81 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  33.9 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  32.12 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  31.52 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0845  co-chaperone HscB  36.7 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0875  co-chaperone HscB  36.7 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0888  co-chaperone HscB  36.7 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  36.7 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  28.22 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  30.54 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  32.54 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01469  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04610)  31.61 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844693  normal  0.0223479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  31.52 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  31.52 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  33.33 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14770  co-chaperone HscB  30.63 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  31.95 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  27.61 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0284  co-chaperone HscB  32.7 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  27.61 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3059  co-chaperone Hsc20  30.95 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  34.21 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  34.26 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  34.26 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  30.72 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  34.26 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0825  co-chaperone Hsc20  29.24 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484161  normal  0.641557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0676  co-chaperone Hsc20  29.24 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33536  predicted protein  33.59 
 
 
237 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.942006  normal  0.145208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  27.44 
 
 
201 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1302  co-chaperone HscB  33.62 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  27.44 
 
 
201 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  27.44 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  30.67 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  26.83 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>