44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0676 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  66.4 
 
 		 502 aa  672    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  66 
 
 		 502 aa  669    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  77.17 
 
 		 504 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  66.94 
 
 		 502 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  66.13 
 
 		 502 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 516 aa  1045    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  40.86 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  40.49 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  40.33 
 
 		 609 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  37.9 
 
 		 526 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  36.2 
 
 		 605 aa  338  9e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  39.1 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  37.73 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  37.3 
 
 		 600 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  37.77 
 
 		 506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  36.08 
 
 		 502 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  36.36 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  32.34 
 
 		 746 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.17 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3998  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.84 
 
 		 484 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.59 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 463 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0471  efflux ABC transporter outer membrane protein  22.82 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2175  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.59 
 
 		 482 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.51 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.81 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.01 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  23.77 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.39 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0925  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.63 
 
 		 494 aa  43.5  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>