26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0297 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 537 aa  1090    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  54.24 
 
 		 600 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  54.04 
 
 		 595 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  50.77 
 
 		 605 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 502 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  38.45 
 
 		 502 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  39.21 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  39.26 
 
 		 502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  37.73 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  34.75 
 
 		 552 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  36.25 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  35.8 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  35.17 
 
 		 526 aa  286  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  34.56 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  36.36 
 
 		 609 aa  276  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  34.72 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 746 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.45 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 471 aa  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.15 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.15 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.15 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>