18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3737 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 496 aa  980    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  40.4 
 
 		 552 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  36.36 
 
 		 516 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  36.13 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  35.31 
 
 		 502 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  35.65 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  36.27 
 
 		 605 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  36.62 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  36.05 
 
 		 595 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  35.85 
 
 		 600 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  32.79 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 502 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  33.19 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  34.72 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 		 526 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  34.19 
 
 		 609 aa  220  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 746 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>